More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1944 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  100 
 
 		 425 aa  812    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  58.57 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  47.37 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  49.24 
 
 		 141 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  47.41 
 
 		 141 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  40.15 
 
 		 177 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  44.74 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  34.27 
 
 		 160 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  36.72 
 
 		 181 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  43.14 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  42.34 
 
 		 187 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  38.35 
 
 		 159 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  36.36 
 
 		 163 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  38.94 
 
 		 184 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  32.68 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  32.68 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  31.94 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  41.41 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  38.02 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  32.33 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  32.33 
 
 		 173 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  40 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  33.33 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  36.81 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  36.92 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  31.82 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.17 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  33.33 
 
 		 169 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  31.16 
 
 		 168 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  33.33 
 
 		 160 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  30.34 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  29.08 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.54 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  36.8 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.86 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  32.79 
 
 		 164 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  38.78 
 
 		 200 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  32.84 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  31.45 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  36.07 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  27.82 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  33.33 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  34.29 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  32.03 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  30.88 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  32.52 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  30.53 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  29.68 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  28.46 
 
 		 140 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  28.24 
 
 		 165 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  28.24 
 
 		 165 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  34.09 
 
 		 183 aa  65.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  32.14 
 
 		 163 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  29.25 
 
 		 165 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  30.65 
 
 		 158 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 159 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  32.52 
 
 		 174 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  30.71 
 
 		 139 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  30.07 
 
 		 155 aa  65.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  31.67 
 
 		 136 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  36.15 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  28.03 
 
 		 161 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.06 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  29.03 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  27.7 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  33.85 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  33.33 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  26.32 
 
 		 907 aa  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  34.48 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  34.65 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  29.45 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  26.17 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  32.09 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  30.6 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  27.7 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.94 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  29.85 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  29.41 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  29.41 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  34.58 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  34.48 
 
 		 167 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  34.48 
 
 		 167 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  41.84 
 
 		 170 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  34.48 
 
 		 167 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  33.59 
 
 		 163 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  31.39 
 
 		 179 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  34.48 
 
 		 167 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  29.85 
 
 		 164 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  33.59 
 
 		 163 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  34.48 
 
 		 167 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  31.34 
 
 		 141 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  34.48 
 
 		 167 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  34.48 
 
 		 167 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  34.48 
 
 		 167 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  29.85 
 
 		 164 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  29.61 
 
 		 167 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  35.77 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  31.82 
 
 		 162 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>