More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0944 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  100 
 
 
141 aa  278  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  72.86 
 
 
141 aa  204  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  54.26 
 
 
161 aa  136  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  50.75 
 
 
177 aa  124  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  48.84 
 
 
425 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  48.84 
 
 
333 aa  118  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  37.6 
 
 
169 aa  84.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.58 
 
 
165 aa  80.1  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  36.17 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.84 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  37.23 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  34.75 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  34.09 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  33.83 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  33.81 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  32.84 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  32.84 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  32.39 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  33.58 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  32.12 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  31.58 
 
 
179 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  35.21 
 
 
187 aa  73.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  33.58 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.58 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  36.69 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  32.39 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  37.4 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.12 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  32.12 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  36.28 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  32.12 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  32.12 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  32.12 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  32.12 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.12 
 
 
164 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  32.12 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  33.08 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.88 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  33.83 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  32.12 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  32.12 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  32.12 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  34.59 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  35.2 
 
 
201 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  28.57 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  29.85 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  35.77 
 
 
518 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  31.58 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  32.12 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  32.12 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  31.29 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  32.19 
 
 
178 aa  70.9  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  32.09 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  31.69 
 
 
200 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  32.12 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  32.61 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  34.86 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.39 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  34.07 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.12 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  32.61 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  29.85 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  31.11 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  33.33 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  34.33 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  32.39 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  31.39 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  30.22 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  28.99 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.08 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.83 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.83 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  28.03 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  29.93 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  33.33 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  34.85 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  33.33 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  28.03 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  32.39 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  31.5 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  30.83 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  30.08 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  30.6 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  29.93 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  33.1 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.71 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  27.66 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  32.65 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.93 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  28.57 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  30.66 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  29.93 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  27.66 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  29.93 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  28.57 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  38.35 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  29.93 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  30.43 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  29.2 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>