More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2550 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  100 
 
 		 169 aa  333  9e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  46.79 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  45.22 
 
 		 907 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  47.74 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  43.98 
 
 		 779 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  39.49 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  37.18 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  38.71 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  34.81 
 
 		 201 aa  87.8  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  33.75 
 
 		 178 aa  87.4  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  37.58 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  37.58 
 
 		 177 aa  85.1  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  37.6 
 
 		 141 aa  84  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  28.85 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  35.29 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  35.06 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  35.03 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  34.39 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  29.73 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  28.39 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  32.47 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  33.33 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  35.66 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  40.57 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  34.01 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  37.21 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  33.12 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  40.16 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  30.46 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  34.13 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  33.12 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  33.33 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  33.33 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  28.21 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  33.97 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  33.06 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  31.37 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  39.62 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  30.61 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  35.59 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  34.09 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  34.09 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  30.77 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  36.8 
 
 		 425 aa  72  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  34.19 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.69 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  31.17 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  31.17 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  30.33 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  30.33 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  29.51 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  32.81 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.51 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  33.54 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  37.3 
 
 		 466 aa  69.3  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  32.79 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  29.51 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  29.51 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1575  CheW protein  28.57 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  29.56 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  29.51 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  26.99 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  29.46 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  32.79 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  29.46 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  30.4 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.39 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.51 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  26.49 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  33.59 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  27.87 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  27.39 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  35.48 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.69 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  26.98 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  30.12 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  27.87 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  28.69 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  28.69 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.82 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  29.11 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  33.06 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  29.11 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  27.39 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  28.57 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.48 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  28.57 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  29.37 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  29.51 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  29.37 
 
 		 154 aa  67  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  35.58 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  29.03 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  29.37 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  30.92 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  31.93 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  33.06 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  31.17 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  26.98 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  35.42 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  29.37 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>