More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1098 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  100 
 
 		 177 aa  350  5.9999999999999994e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  68.75 
 
 		 178 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  68.48 
 
 		 178 aa  219  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  58.33 
 
 		 181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  64.24 
 
 		 160 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  58.71 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  62.58 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  60 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  47.67 
 
 		 190 aa  154  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  59.66 
 
 		 179 aa  154  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  50.98 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  46.34 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  47.02 
 
 		 169 aa  141  4e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  50 
 
 		 189 aa  140  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  37.58 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  41.94 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  36.05 
 
 		 150 aa  87.4  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  33.53 
 
 		 907 aa  87.4  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  32.14 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  35 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  32.56 
 
 		 518 aa  82.4  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  34.67 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  38.41 
 
 		 779 aa  81.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  34.67 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  31.06 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  30.77 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  34 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  30.19 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  34.01 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  45.54 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  34.46 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  28.05 
 
 		 301 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  31.33 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.12 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  33.12 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  33.12 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  33.12 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  33.12 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.12 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  36.24 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  32.47 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  26.06 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  32.08 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  32.47 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.08 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  32.47 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  32.67 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  34.72 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.08 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.08 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  32 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  32.47 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  32.47 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.08 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  34 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  34 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  31.33 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  36.29 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  32 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  44 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  31.54 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  30.86 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  31.54 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.89 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  31.68 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  33.87 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  31.37 
 
 		 478 aa  74.3  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  32.08 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  30.43 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  35.04 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  33.1 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  37.72 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.64 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  35.92 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  40.62 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  32 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0388  CheW protein  35.78 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  40.62 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  39.8 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  40 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  30.41 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  32.67 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  39.8 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  32.8 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  30.07 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.89 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  29.23 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.75 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  28.46 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  38.38 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  25.68 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.66 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.69 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  31.78 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  31.78 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.69 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  28.92 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.69 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  29.68 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>