More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1925 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  100 
 
 
174 aa  341  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  70.32 
 
 
169 aa  218  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  48.52 
 
 
187 aa  156  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  49.33 
 
 
160 aa  148  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  49.32 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  46.34 
 
 
177 aa  142  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  49.35 
 
 
201 aa  141  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  44.31 
 
 
178 aa  140  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  46.79 
 
 
178 aa  137  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  45.62 
 
 
190 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  46.62 
 
 
200 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  49.32 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  46.62 
 
 
189 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  48.63 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  38.22 
 
 
170 aa  94.4  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  37.18 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  42.21 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  40 
 
 
907 aa  90.1  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  39.55 
 
 
189 aa  87.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  34.09 
 
 
779 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  36.11 
 
 
171 aa  82  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  37.5 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  36.17 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.73 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  35.66 
 
 
301 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  32.67 
 
 
404 aa  77.8  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  32.43 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  33.93 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  33.57 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  37.8 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  38.94 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  35.65 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  31.06 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.86 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  37.27 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0759  CheW protein  29.46 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0623723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  35.64 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  29.17 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.47 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.47 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.47 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  30.3 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  31.29 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.07 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.65 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  37.6 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  35 
 
 
425 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.21 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  32.46 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  28.87 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  35.48 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  34.15 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  31.37 
 
 
164 aa  72  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  31.2 
 
 
179 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  34.45 
 
 
200 aa  72  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.59 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  34.81 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  29.34 
 
 
163 aa  72  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  36.29 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  32.39 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  33.33 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  32.39 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  31.17 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  28.19 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  28.19 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  36.84 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  27.27 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  32.65 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.19 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  28.19 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  28.19 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  28.19 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  31.4 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  34.65 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  33.59 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  36.19 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  34.65 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  39.8 
 
 
518 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  34.59 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  26.71 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  34.59 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.5 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  32.72 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  33.33 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  30.08 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1575  CheW protein  38.32 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  34.27 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  27.54 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  28.66 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  35.58 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  30.26 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.67 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  28 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  36 
 
 
344 aa  68.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  28.57 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.57 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  26.67 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  28.57 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  28.57 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.57 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>