More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3468 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  100 
 
 		 153 aa  299  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  40.85 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  40.14 
 
 		 155 aa  97.1  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  40.3 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  40 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  36 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  36.69 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  33.78 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  37.96 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  36.62 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  37.5 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  38.03 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  34.04 
 
 		 161 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  37.16 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  31.08 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  31.08 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  31.08 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  33.79 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  37.84 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  32.35 
 
 		 216 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  36.94 
 
 		 158 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  35.97 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  35.97 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  36.94 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  37.96 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  33.81 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  33.33 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  37.78 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  34.07 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  32.12 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  32.35 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  35.29 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  32.12 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  36.05 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  31.29 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  35.88 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1575  CheW protein  32.17 
 
 		 239 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  33.07 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  33.07 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  33.88 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  33.07 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  33.1 
 
 		 187 aa  73.9  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  33.07 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  34.15 
 
 		 166 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  30.15 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  27.89 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  29.85 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  29.58 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.73 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  33.81 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  33.11 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0722  CheW protein  30.22 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  33.33 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  34.92 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  32.65 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  31.25 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  31.25 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  34.92 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  34.92 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  34.92 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  34.92 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  34.92 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  31.97 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  34.92 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  34.92 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  34.92 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  31.5 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  32 
 
 		 183 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  34.53 
 
 		 179 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  30.87 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  32.12 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  30.87 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  34.92 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  37.4 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  34.65 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  34.65 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  31.62 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  30.2 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0755  CheW protein  30.5 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  34.75 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  32.28 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1476  CheW protein  34.23 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.331722  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  34.65 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  34.92 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  31.5 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  31.08 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  34.45 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  30.82 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  32.54 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  31.21 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  34.85 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  31.5 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  31.5 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  34.06 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  30.25 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  31.5 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  31.5 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>