More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0722 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0722  CheW protein  100 
 
 
143 aa  288  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  38.32 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  44.68 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  47.73 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  30.22 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  35.58 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  33.63 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  30.88 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  32.61 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  35.04 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  31.03 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  30.43 
 
 
159 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  30.43 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  30.7 
 
 
194 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  30.7 
 
 
194 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.3 
 
 
159 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  31.58 
 
 
163 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  31.3 
 
 
159 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  31.3 
 
 
159 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  34.02 
 
 
154 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  31.3 
 
 
159 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.29 
 
 
163 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  30.7 
 
 
194 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.17 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  30.43 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  32.46 
 
 
162 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  30.43 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  30.43 
 
 
164 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  30.43 
 
 
164 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  32.32 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.06 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2099  CheW protein  27.88 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.71 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  29.37 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  30.71 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  35.45 
 
 
179 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  32.76 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.37 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.41 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  29.08 
 
 
179 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  28.87 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30.43 
 
 
163 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  30.77 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  27.34 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  29.91 
 
 
191 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  29.75 
 
 
194 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.06 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  29.91 
 
 
191 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  27.66 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  28.32 
 
 
533 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  26.89 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  27.86 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  27.86 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  28.89 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  27.86 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  27.86 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  27.86 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  34.62 
 
 
520 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.86 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  25.93 
 
 
158 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  30.19 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  32.43 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  36.36 
 
 
218 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  27.86 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  29.41 
 
 
174 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  27.87 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.86 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.86 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.89 
 
 
162 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.43 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.79 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  27.86 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  27.21 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  25.93 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.57 
 
 
164 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  25.93 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  28.69 
 
 
163 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  24.32 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  27.86 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  31.3 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  30.94 
 
 
174 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  30.91 
 
 
159 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  29.9 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  28.78 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  30.77 
 
 
158 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  28.78 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  29.31 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  29.82 
 
 
169 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  31.13 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  28.26 
 
 
181 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  25.52 
 
 
183 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  24.82 
 
 
169 aa  53.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  27.19 
 
 
167 aa  53.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  30.48 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  29.17 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  31.91 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  27.01 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  29.29 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.17 
 
 
165 aa  52.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>