More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2261 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  100 
 
 		 161 aa  310  3.9999999999999997e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  52.67 
 
 		 141 aa  137  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  54.26 
 
 		 141 aa  136  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  46.92 
 
 		 425 aa  127  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  51.16 
 
 		 177 aa  121  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  42.31 
 
 		 333 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  35.86 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  33.1 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  29.09 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  37.17 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  31.41 
 
 		 200 aa  73.9  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  28.48 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  35.4 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  33.33 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  31.72 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  34.19 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  30.94 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  32.62 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  30.71 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  32.12 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  30.67 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  39.42 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  36.7 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  31.34 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  30.92 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  27.15 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  30.82 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  30.83 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  34.13 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.1 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  32.28 
 
 		 331 aa  67  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  31.08 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  26.24 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  30.46 
 
 		 518 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  30.28 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  29.68 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  27.1 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  27.15 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  27.1 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  33.55 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  30.94 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  35.29 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  29.69 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  33.79 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  34.92 
 
 		 479 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  34.97 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  31.82 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  36.36 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  27.27 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  26.97 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  33.09 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  27.27 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  33.93 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  28.78 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  33.09 
 
 		 907 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.11 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  29.77 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  28.57 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  30.3 
 
 		 531 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  25.36 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  29.85 
 
 		 141 aa  62  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  32.28 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  30.41 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  30.41 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  30.41 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  27.85 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  27.56 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  26.11 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  28.89 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  25.69 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  28.99 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  30 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  27.66 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.38 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  32.48 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  29.63 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  27.81 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  26.14 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  29.05 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  30.63 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  26.32 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2363  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like protein  27.66 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  31.37 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  26.14 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  26.47 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.89 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  32.19 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  25.61 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  29.93 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  29.94 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  27.34 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  31.69 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  30.83 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  26.28 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  28 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  25.71 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  27.97 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4120  CheW protein  29.58 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000127849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  26.81 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>