More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0967 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  100 
 
 		 178 aa  346  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  77.06 
 
 		 178 aa  256  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  68.75 
 
 		 177 aa  231  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  58.66 
 
 		 181 aa  197  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  65.56 
 
 		 160 aa  197  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  58.43 
 
 		 201 aa  190  8e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  61.94 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  62.11 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  59.66 
 
 		 179 aa  154  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  51.02 
 
 		 190 aa  140  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  46.79 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  45.22 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  45.1 
 
 		 200 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  45.16 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  37.66 
 
 		 170 aa  97.4  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  41.56 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  43.09 
 
 		 124 aa  84.3  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  36.94 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  33.78 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  34.13 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  37.25 
 
 		 907 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  44 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  31.58 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  36 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  36 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  33.33 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  35.86 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  34.21 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.92 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  32.9 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  35.53 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  32.45 
 
 		 404 aa  78.2  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  29.94 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.67 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  43.3 
 
 		 425 aa  77.4  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.48 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  35.9 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  41.28 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  30.37 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  40.38 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  36.29 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  33.76 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  33.55 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  29.94 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.83 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  34.13 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  34.68 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  31.68 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.47 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.27 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.47 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  40 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.47 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  40 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  38.38 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.72 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.12 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.65 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  38.12 
 
 		 779 aa  73.2  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  36.61 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  38.14 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2270  CheW protein  57.14 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.476582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  33.56 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  32.19 
 
 		 136 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0388  CheW protein  33.64 
 
 		 154 aa  72  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  28.86 
 
 		 170 aa  72  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.9 
 
 		 164 aa  72  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  40.4 
 
 		 333 aa  71.6  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  35 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.9 
 
 		 164 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.9 
 
 		 164 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.9 
 
 		 164 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  35.54 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.54 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.54 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  31.52 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.54 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.54 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  36.63 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  36.63 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  36.63 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  36.63 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  36.27 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.9 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  33.83 
 
 		 518 aa  71.2  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  29.84 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.9 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  36.46 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  31.29 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  36.19 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.9 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.9 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.73 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  37.62 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.9 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  31.51 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  37.62 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  26.8 
 
 		 478 aa  69.7  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  29.33 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>