219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2270 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2270  CheW protein  100 
 
 		 82 aa  161  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.476582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  58.62 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  75.51 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  75.51 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  73.47 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  72.92 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  55.93 
 
 		 178 aa  72  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  49.4 
 
 		 187 aa  72  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  65.96 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  58.82 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  48.48 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  68.09 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  64.58 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  59.57 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  59.57 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  57.45 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  53.19 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  40 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  40 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  39.68 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  51.06 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  44 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  37.68 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  52.94 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  44 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  50 
 
 		 779 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  50.98 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  42.86 
 
 		 176 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  40.35 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  46.94 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  40.35 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  36.17 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  48.15 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  36.17 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  41.67 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  36.17 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  42 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  42 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  41.67 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  42 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  40.74 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  36.17 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  41.67 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  42.55 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  38 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  38 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  39.29 
 
 		 161 aa  47.4  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  39.13 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  46.94 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  48.94 
 
 		 907 aa  47.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  29.51 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  36.07 
 
 		 164 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  33.96 
 
 		 306 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  42.86 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  36.96 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  46.94 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  40.74 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  40.74 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  44.44 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  37.5 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  36.51 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.92 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  46.94 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  45.65 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  40.43 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  44 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  42.86 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  34.92 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  34.92 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  45.65 
 
 		 425 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  34.92 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  38.89 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  46.94 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  42.86 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  39.58 
 
 		 308 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  42.86 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  35.85 
 
 		 306 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.67 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  41.67 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  41.67 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  35.71 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  41.67 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  41.67 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  42.86 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  41.67 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  38.46 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  34.92 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  34.92 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  34.92 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  36.76 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  41.67 
 
 		 301 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  41.67 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  34.62 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  34.92 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  38.89 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.62 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  41.3 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3228  putative CheW protein  37.04 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000337303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  39.58 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  35.48 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>