More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0960 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  100 
 
 		 779 aa  1573    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  40.27 
 
 		 907 aa  157  9e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  47.2 
 
 		 170 aa  153  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  42.77 
 
 		 169 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  40.99 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  37.04 
 
 		 200 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  37.74 
 
 		 169 aa  84.3  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  34.12 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  34.09 
 
 		 174 aa  83.2  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  31.79 
 
 		 190 aa  82.4  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  38.41 
 
 		 177 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  34.1 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  36.9 
 
 		 181 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  36.54 
 
 		 160 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  41.6 
 
 		 179 aa  78.2  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  43.48 
 
 		 155 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  38.04 
 
 		 201 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  42.57 
 
 		 163 aa  75.5  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2533  CheW protein  30.91 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  44.14 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  33.87 
 
 		 156 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  33.87 
 
 		 156 aa  73.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  38.12 
 
 		 178 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  35.91 
 
 		 187 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  32.26 
 
 		 154 aa  72.8  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  40.4 
 
 		 179 aa  72  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  33.87 
 
 		 154 aa  71.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  41 
 
 		 161 aa  70.5  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  38.89 
 
 		 165 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  38.89 
 
 		 165 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  33.98 
 
 		 177 aa  68.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  30.91 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  30.77 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  40 
 
 		 161 aa  66.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  29.68 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  38 
 
 		 161 aa  65.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  39.6 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  34.38 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  32.81 
 
 		 167 aa  65.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  40.43 
 
 		 179 aa  65.1  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  33.12 
 
 		 146 aa  64.3  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  34.29 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  30 
 
 		 159 aa  63.9  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  34 
 
 		 163 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  36.54 
 
 		 160 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  35.16 
 
 		 174 aa  63.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  26.97 
 
 		 141 aa  63.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  45.95 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  33.64 
 
 		 147 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  33.64 
 
 		 147 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  32.2 
 
 		 159 aa  62.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  35.29 
 
 		 189 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  37.86 
 
 		 173 aa  63.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  32.35 
 
 		 155 aa  62.4  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  29.58 
 
 		 155 aa  62.4  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  39.82 
 
 		 194 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.29 
 
 		 162 aa  62  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  33.33 
 
 		 146 aa  62  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  39.82 
 
 		 194 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  36.84 
 
 		 185 aa  62  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  36.28 
 
 		 171 aa  62  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  36.84 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  33.85 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  36.59 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  28.99 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  30.61 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  38.94 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  37.72 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  32.03 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  34.11 
 
 		 154 aa  60.8  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.14 
 
 		 164 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  37.5 
 
 		 167 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  33.81 
 
 		 164 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  31.3 
 
 		 170 aa  60.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  32.73 
 
 		 194 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  33.33 
 
 		 185 aa  60.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  31.85 
 
 		 157 aa  60.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  30.77 
 
 		 157 aa  60.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  29.41 
 
 		 141 aa  60.1  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  29.01 
 
 		 151 aa  60.1  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  35.96 
 
 		 183 aa  60.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  35.42 
 
 		 333 aa  60.1  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  29.82 
 
 		 179 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  39.36 
 
 		 184 aa  59.7  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  36.52 
 
 		 165 aa  60.1  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  30.23 
 
 		 153 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  37.89 
 
 		 169 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  30.58 
 
 		 183 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  36.52 
 
 		 165 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  33.02 
 
 		 175 aa  60.1  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  35.4 
 
 		 165 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  29.13 
 
 		 154 aa  60.1  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  29.25 
 
 		 170 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  29.52 
 
 		 189 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  35.14 
 
 		 164 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  34.95 
 
 		 165 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  30.6 
 
 		 158 aa  59.3  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  31.71 
 
 		 152 aa  59.3  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  32.28 
 
 		 161 aa  59.3  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  33.65 
 
 		 157 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>