More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2533 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2533  CheW protein  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  30.91 
 
 		 779 aa  74.3  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  28.21 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  29.46 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  36.08 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  33.33 
 
 		 325 aa  62  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  24.68 
 
 		 907 aa  61.6  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  29.69 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  30.51 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2825  CheW protein  30.51 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0169826  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2917  CheW protein  30.51 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0128813  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  29.17 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  26.8 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  34.94 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  36.36 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  34.69 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  29.46 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  36.46 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  29.25 
 
 		 344 aa  58.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.29 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  29.06 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  29.23 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  28.36 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  32.99 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  26.98 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  24.52 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  29.51 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  27.03 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  35.29 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  34.65 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  25 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  25.53 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.08 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  27.78 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  34.51 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  27.33 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4203  CheW protein  32.32 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.017726  normal  0.169541 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  25.58 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  25.58 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.01 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  24.11 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  30.08 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.01 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  30.85 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  25 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  26.98 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  25 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  25.16 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  25.93 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  33 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.42 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  32.46 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  27.42 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  29.01 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  27.48 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.16 
 
 		 183 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  29.47 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  30.11 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  27.56 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.42 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  29.25 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  25.95 
 
 		 163 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  33.65 
 
 		 531 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  35.71 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.3 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  28.1 
 
 		 171 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  27.81 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  29.59 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.3 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.3 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.3 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  27.27 
 
 		 141 aa  52  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  26.02 
 
 		 179 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  28.24 
 
 		 185 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31 
 
 		 161 aa  52  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  34.78 
 
 		 161 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  27.72 
 
 		 167 aa  51.6  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  30 
 
 		 164 aa  51.6  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  26.61 
 
 		 157 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  31.58 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  30.69 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  29.52 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  24.37 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  31.31 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  30.43 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  31.58 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  31.58 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.86 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  31.58 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  29.51 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  25.78 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0744  CheW protein  25.58 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  30.85 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  24.8 
 
 		 167 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  24.03 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  29.2 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  27.2 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  24.03 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  32.26 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  29.27 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>