More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2460 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  100 
 
 		 181 aa  362  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  56.71 
 
 		 205 aa  197  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  50 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  50 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  48.19 
 
 		 200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  45.66 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  44.17 
 
 		 325 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  38.86 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  35 
 
 		 344 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  35 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  35.57 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  36.36 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  31.47 
 
 		 163 aa  88.6  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  31.33 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  28.82 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.66 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  30 
 
 		 145 aa  85.9  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  31.61 
 
 		 161 aa  85.1  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  30.88 
 
 		 163 aa  85.1  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  33.55 
 
 		 186 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  30.41 
 
 		 167 aa  84.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  37.96 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  29.1 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  37.96 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  32.09 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  31.62 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  27.75 
 
 		 201 aa  80.9  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  30.5 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  31.47 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  33.59 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  31.33 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  31.97 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  31.33 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.22 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  29.66 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  28.75 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  28.48 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  30.43 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  25.33 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  30 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  30.71 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  30.33 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  31.03 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.5 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.41 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  28.67 
 
 		 444 aa  76.3  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  29.68 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  23.95 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.06 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  30 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.12 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  30.33 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  30.56 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  32.37 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1000  putative CheW protein  34.29 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  29.61 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.17 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  31.79 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  30.71 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  27.89 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  27.52 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  27.89 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  28.21 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  27.89 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  27.89 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  30.66 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  27.59 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  30.66 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  29.45 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  31.65 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  30.22 
 
 		 365 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  28.95 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  27.63 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  27.89 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  24.84 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  30.41 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  25.58 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  25.49 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  30.97 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  29.08 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  31.47 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  26.79 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  28.85 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  30.57 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  29.27 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  28.17 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  27.89 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  29.58 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1154  putative CheW protein  27.54 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.239991  normal  0.152516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.21 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  27.61 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.09 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.21 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.21 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  28.57 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  27.21 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  29.41 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  26.88 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  27.86 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.89 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>