More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0793 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  100 
 
 
365 aa  720    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  95.89 
 
 
365 aa  661    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  28.13 
 
 
342 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  18.72 
 
 
518 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  32.65 
 
 
205 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  30 
 
 
189 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  22.95 
 
 
515 aa  80.1  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.27 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  28.24 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.1 
 
 
165 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.49 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  26.49 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  26.49 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  26.49 
 
 
164 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  29.08 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  29.08 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  27.34 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  29.82 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  29.55 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  27.03 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  32.39 
 
 
165 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  27.34 
 
 
164 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  30.43 
 
 
175 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  31.43 
 
 
146 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  31.25 
 
 
146 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  27.15 
 
 
162 aa  74.7  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  27.34 
 
 
164 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  32.19 
 
 
163 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  27.66 
 
 
163 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  29.69 
 
 
158 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  26.62 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  26.62 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  26.62 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  28.37 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  25.53 
 
 
162 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  26.62 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  32.35 
 
 
146 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  30.07 
 
 
136 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  23.78 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  29.69 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.62 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  30.56 
 
 
163 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  32.8 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  31.43 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  32.8 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  26.06 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  28.68 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.8 
 
 
174 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  30.88 
 
 
148 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  25.9 
 
 
163 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  28.78 
 
 
159 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  30.66 
 
 
164 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  29.45 
 
 
218 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  28.99 
 
 
155 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  31.65 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  28.79 
 
 
163 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  24.66 
 
 
159 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  26.17 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  24.49 
 
 
159 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  27.45 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  29.71 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  27.45 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  25.19 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.53 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  24.49 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  25.19 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  25 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  25 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  25 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  30 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  25 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  29.58 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  28.26 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  21.07 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  25.5 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  26.76 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  29.63 
 
 
165 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  25.85 
 
 
176 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  25.19 
 
 
156 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  31.53 
 
 
181 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  25.19 
 
 
156 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  29.63 
 
 
165 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  24.84 
 
 
164 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  28.57 
 
 
168 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  25.17 
 
 
159 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  25.85 
 
 
161 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  26.62 
 
 
168 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  25 
 
 
167 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  25.52 
 
 
164 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  27.2 
 
 
149 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  25.15 
 
 
199 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.79 
 
 
164 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  30.41 
 
 
154 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  29.8 
 
 
167 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  27.4 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  32.45 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  20 
 
 
533 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  27.97 
 
 
147 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  27.92 
 
 
159 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  25.17 
 
 
159 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>