More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1327 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  100 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  53.01 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  46.49 
 
 		 199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  47.27 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  50 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  41.48 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  42.04 
 
 		 325 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  39.29 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  34.29 
 
 		 344 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  33.91 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  34.06 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.09 
 
 		 163 aa  87.8  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  34.07 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  32.12 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  32.35 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  32.45 
 
 		 162 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  33.85 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.09 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.94 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  31.13 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  30 
 
 		 365 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  31.29 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  31.33 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  30.34 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  28.68 
 
 		 167 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  30.88 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  30.13 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  27.94 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1000  putative CheW protein  35.84 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  30.22 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  30.22 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  33.1 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.22 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  32.84 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  29.55 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  28.22 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  26.76 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  34.27 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  33.1 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  34.11 
 
 		 907 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.06 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.37 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  34.69 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  34.69 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  34.46 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.06 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  29.2 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  28.99 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  33.06 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  34.81 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  34.81 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  34.81 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.17 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.17 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  31.25 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  30.43 
 
 		 262 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.17 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.74 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  31.72 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  28.06 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  28.81 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  28.03 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.74 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.74 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  32.52 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  27.74 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  28.47 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  28.68 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  32.87 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  27.01 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  32.65 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  26.47 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  32.87 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  27.74 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  28.06 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  32.87 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  32.87 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  29.01 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  32.87 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  31.72 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  35.07 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  27.74 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  29.13 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  27.74 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  27.74 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  29.13 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  27.74 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  34.33 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  28.68 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>