More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2883 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  100 
 
 
177 aa  353  5.999999999999999e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  50.75 
 
 
141 aa  125  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  51.49 
 
 
141 aa  123  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  51.16 
 
 
161 aa  122  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  43.75 
 
 
333 aa  97.1  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  40 
 
 
425 aa  93.2  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  35.11 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  37.5 
 
 
212 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  36.76 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  39.13 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  33.58 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  32.87 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  31.21 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  32.17 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  31.34 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  32.33 
 
 
171 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  36.09 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.63 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  30.61 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  28.15 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  31.21 
 
 
907 aa  71.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  34.01 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  37.96 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  33.83 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  31.11 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  29.32 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  31.94 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  34.4 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  32.65 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  29.85 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  37.04 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  34.23 
 
 
779 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  29.85 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  30.53 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  29.93 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  31.47 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  31.69 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  31.11 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  35.51 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  30.99 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  28.67 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  30.43 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  43.24 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  30.43 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  26.87 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  29.1 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  29.1 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  27.82 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  33.33 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  29.77 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  29.1 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  33.33 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  30.71 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  29.1 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  29.63 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  35.43 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  34.51 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.53 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  32.33 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  29.8 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  31.06 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  32.69 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  29.79 
 
 
404 aa  64.7  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  30.83 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  31.54 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  27.78 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  32.41 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  29.37 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  28.36 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  29.85 
 
 
150 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  36.56 
 
 
344 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.77 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.32 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.32 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  31.93 
 
 
164 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  27.63 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  28.77 
 
 
238 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  30 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  28.89 
 
 
163 aa  63.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  32.58 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  31.61 
 
 
253 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  25.74 
 
 
189 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0576  purine-binding chemotaxis protein  26.62 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  30.95 
 
 
169 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  28.57 
 
 
162 aa  62.4  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  31.87 
 
 
155 aa  62  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  32.59 
 
 
148 aa  62  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1575  CheW protein  29.23 
 
 
239 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0210476  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  27.07 
 
 
167 aa  61.6  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  32.79 
 
 
165 aa  61.6  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  26.32 
 
 
331 aa  61.6  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  29.69 
 
 
518 aa  61.6  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  28.46 
 
 
136 aa  61.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  32.33 
 
 
194 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  28.66 
 
 
170 aa  61.2  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  37 
 
 
147 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  34.69 
 
 
183 aa  61.2  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  32.58 
 
 
316 aa  61.2  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  43.24 
 
 
170 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  31.94 
 
 
169 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>