More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1069 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  100 
 
 		 160 aa  319  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  95.6 
 
 		 181 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  84.18 
 
 		 184 aa  240  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  74.84 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  63.82 
 
 		 201 aa  204  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  65.56 
 
 		 178 aa  197  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  64.24 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  60.93 
 
 		 178 aa  191  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  66.89 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  52.26 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  48.37 
 
 		 169 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  49.33 
 
 		 174 aa  148  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  50 
 
 		 200 aa  148  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  50.32 
 
 		 189 aa  147  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  36 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  41.33 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  36.13 
 
 		 404 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  35.37 
 
 		 907 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  34.85 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  38.1 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  33.33 
 
 		 141 aa  84.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  32.67 
 
 		 141 aa  84.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  36.07 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  37.33 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  33.55 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  34.69 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0689  CheW protein  35 
 
 		 333 aa  81.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  36.73 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  33.33 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  31.58 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  32.82 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.12 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  34.9 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.35 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  34.53 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  34.39 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  36.54 
 
 		 779 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1944  CheW protein  33.57 
 
 		 425 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  37.8 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  37.8 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.58 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  28.66 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  28.48 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.62 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  37.69 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  37.69 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  37.74 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  38.46 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2261  CheW protein  33.1 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  32.35 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  37.74 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  37.74 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  29.93 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  45.95 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  33.33 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  28 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  33.33 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  39.81 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  39.81 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  36.7 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  39.81 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  37.8 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  30.08 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  35.17 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  30.88 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  41.05 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  29.93 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  34.21 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  30 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  30.32 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  34.65 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  41.58 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  32.56 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  30.52 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  32.19 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.13 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  30.88 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  32.12 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  35.71 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  30.63 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  31.82 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  33.77 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  31.79 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  31.72 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  31.37 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  28.99 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  29.1 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  30.95 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  29.1 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  33.79 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  30.2 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  29.69 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  28.57 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  32.03 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  30.16 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  38.24 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>