198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1642 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1642  CheW protein  100 
 
 		 124 aa  247  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  43.09 
 
 		 178 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  41.44 
 
 		 169 aa  84.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  45.54 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  44.14 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  45.95 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  45.95 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  45.95 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  40.35 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  37.7 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  38.94 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  40.16 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  40 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  40.16 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  35.54 
 
 		 907 aa  67.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0944  CheW protein  34.75 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  43.24 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  33.06 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  36.59 
 
 		 779 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  51.43 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  33.04 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  28.97 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  31.9 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  25.74 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  32.08 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  29.84 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  32 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  33.33 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  25 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  31.9 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  31.25 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  32.29 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  32.29 
 
 		 159 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0691  putative CheW protein  31.19 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  28.57 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  30.16 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  33.03 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  27.93 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  34.31 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  31.46 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  31.4 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  29.29 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  27.19 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  34.09 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  23.68 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  34.09 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  31.03 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  27.03 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  27.84 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  35.11 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  29.73 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  28 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  31.43 
 
 		 169 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  26.27 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  29.03 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.17 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  29.17 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  29.17 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  27.97 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  29.17 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  41.94 
 
 		 183 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  36.84 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  36.76 
 
 		 518 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  29.17 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  28.12 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  39.71 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  31.43 
 
 		 301 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  29.17 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0932  putative CheW protein  31.15 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.432309  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  29.6 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  27.12 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  27.97 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  28.57 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  31.4 
 
 		 478 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  27.12 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  42.65 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  27.12 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  27.12 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  25.66 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  29.17 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  27.12 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  27 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  27.97 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.12 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  38.24 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  29.73 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.12 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.12 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  27.12 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  29.09 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  32.65 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1415  CheW protein  30.56 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  27.64 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  35.38 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  29.29 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  30.09 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  27.12 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  31.73 
 
 		 318 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  31.52 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>