More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2309 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  100 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  75.17 
 
 		 159 aa  222  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  48.12 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  41.92 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  56.32 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  56.14 
 
 		 275 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  40.3 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  44.78 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  39.46 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  41.98 
 
 		 158 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  37.31 
 
 		 165 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  39.04 
 
 		 158 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  42.28 
 
 		 165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  37.86 
 
 		 163 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  35.56 
 
 		 162 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  42.5 
 
 		 158 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  38.97 
 
 		 170 aa  108  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  34.33 
 
 		 159 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  43.33 
 
 		 166 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  40.83 
 
 		 158 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  38.06 
 
 		 167 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  29.45 
 
 		 168 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  33.82 
 
 		 165 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  34.31 
 
 		 160 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  34.31 
 
 		 159 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  41.13 
 
 		 164 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  36.55 
 
 		 163 aa  102  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  38.06 
 
 		 147 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  36.17 
 
 		 159 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  37.31 
 
 		 165 aa  99.8  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  34.07 
 
 		 162 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  34.07 
 
 		 192 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  31.33 
 
 		 165 aa  99.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  31.33 
 
 		 165 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  35.56 
 
 		 150 aa  98.2  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.35 
 
 		 164 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  32.17 
 
 		 167 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  39.42 
 
 		 141 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  35.77 
 
 		 161 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.3 
 
 		 165 aa  97.1  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  33.09 
 
 		 168 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 174 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  31.43 
 
 		 164 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  33.33 
 
 		 164 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  32.59 
 
 		 164 aa  96.3  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  37.86 
 
 		 163 aa  96.3  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.85 
 
 		 163 aa  96.3  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  31.79 
 
 		 164 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  38.52 
 
 		 149 aa  95.5  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  31.85 
 
 		 159 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  32.65 
 
 		 148 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  38.06 
 
 		 141 aa  94.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.11 
 
 		 161 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  31.85 
 
 		 159 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  40.44 
 
 		 169 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  30.71 
 
 		 163 aa  93.6  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  33.58 
 
 		 148 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.11 
 
 		 159 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  31.11 
 
 		 159 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  31.54 
 
 		 163 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  31.11 
 
 		 159 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  31.11 
 
 		 159 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  30.37 
 
 		 163 aa  92.8  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  32.85 
 
 		 165 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  32.85 
 
 		 165 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  31.11 
 
 		 163 aa  92.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  35.71 
 
 		 179 aa  92.4  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  34.81 
 
 		 150 aa  92  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  34.59 
 
 		 169 aa  92  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  37.04 
 
 		 160 aa  92  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  29.5 
 
 		 218 aa  92  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.93 
 
 		 159 aa  91.7  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  34.25 
 
 		 167 aa  91.7  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  35.82 
 
 		 146 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.11 
 
 		 164 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  30.37 
 
 		 159 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  36.76 
 
 		 140 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  34.09 
 
 		 161 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  30.37 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  30.37 
 
 		 159 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.37 
 
 		 164 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  32.61 
 
 		 177 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  30.37 
 
 		 164 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  30.37 
 
 		 164 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  35.29 
 
 		 518 aa  90.9  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  30.37 
 
 		 159 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  32.61 
 
 		 177 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  30.37 
 
 		 164 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  33.1 
 
 		 157 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  32.61 
 
 		 171 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  32.61 
 
 		 171 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  30.37 
 
 		 164 aa  90.1  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.89 
 
 		 161 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  34.06 
 
 		 154 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  29.63 
 
 		 164 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  36.13 
 
 		 187 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  32.09 
 
 		 162 aa  90.1  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>