More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0742 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  100 
 
 		 275 aa  535  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  89.86 
 
 		 276 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  51.03 
 
 		 262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  56.32 
 
 		 238 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  59.86 
 
 		 159 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  50.56 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  43.06 
 
 		 183 aa  136  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  41.48 
 
 		 158 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  38.97 
 
 		 168 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  39.57 
 
 		 162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  40.15 
 
 		 159 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  44.03 
 
 		 163 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  40.4 
 
 		 169 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  39.71 
 
 		 170 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  43.55 
 
 		 164 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  39.31 
 
 		 163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  38.62 
 
 		 165 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  38.81 
 
 		 147 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  40.83 
 
 		 158 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  38.97 
 
 		 168 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  40 
 
 		 158 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  37.24 
 
 		 165 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  38.81 
 
 		 167 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  37.24 
 
 		 165 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.24 
 
 		 164 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  42.22 
 
 		 165 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  37.04 
 
 		 145 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  39.17 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  34.69 
 
 		 164 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  35.07 
 
 		 159 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  32.87 
 
 		 165 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  39.13 
 
 		 533 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  39.86 
 
 		 166 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  34.44 
 
 		 173 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  35.71 
 
 		 161 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  38.62 
 
 		 162 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  38.85 
 
 		 185 aa  103  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  37.79 
 
 		 203 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  38.97 
 
 		 164 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.55 
 
 		 165 aa  102  6e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  38.24 
 
 		 164 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  36.23 
 
 		 163 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  33.82 
 
 		 165 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  39.19 
 
 		 165 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  35.71 
 
 		 163 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  33.82 
 
 		 165 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  34.23 
 
 		 174 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  34.93 
 
 		 518 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 164 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  37.21 
 
 		 165 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  37.5 
 
 		 166 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  35.86 
 
 		 163 aa  99.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  33.56 
 
 		 174 aa  99.8  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  35.82 
 
 		 171 aa  99.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  37.32 
 
 		 175 aa  99.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  35.56 
 
 		 163 aa  99.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  35.29 
 
 		 165 aa  99.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  36.91 
 
 		 162 aa  99.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.15 
 
 		 173 aa  99.4  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  37.32 
 
 		 175 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  37.32 
 
 		 175 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  37.32 
 
 		 175 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.15 
 
 		 173 aa  99.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  37.32 
 
 		 175 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  37.32 
 
 		 175 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  36.62 
 
 		 162 aa  99.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  36.67 
 
 		 162 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  37.32 
 
 		 175 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  34 
 
 		 174 aa  99.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.15 
 
 		 173 aa  99.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  37.32 
 
 		 175 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  36.03 
 
 		 183 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  36.91 
 
 		 162 aa  99.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  34.07 
 
 		 160 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  37.68 
 
 		 163 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  37.31 
 
 		 157 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  36.57 
 
 		 158 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  36.23 
 
 		 171 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  36.84 
 
 		 166 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  32.86 
 
 		 157 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  34.33 
 
 		 148 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  33.78 
 
 		 184 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.07 
 
 		 174 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  35.86 
 
 		 163 aa  97.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  44.07 
 
 		 179 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  36.96 
 
 		 174 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  34.07 
 
 		 164 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  34.07 
 
 		 164 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  35.61 
 
 		 161 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  34.07 
 
 		 162 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  38.81 
 
 		 156 aa  97.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  31.97 
 
 		 169 aa  96.7  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  34.81 
 
 		 166 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  35.85 
 
 		 174 aa  96.3  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  42.2 
 
 		 520 aa  96.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  34.39 
 
 		 171 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  35.51 
 
 		 171 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  35 
 
 		 194 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  35.51 
 
 		 177 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  35 
 
 		 194 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>