More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1730 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  100 
 
 		 203 aa  406  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  39.46 
 
 		 238 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  40.91 
 
 		 253 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  36.73 
 
 		 262 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  44.37 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  36.7 
 
 		 276 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  31.58 
 
 		 168 aa  92  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  26.53 
 
 		 159 aa  91.7  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.05 
 
 		 164 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  37.95 
 
 		 275 aa  89.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  31.21 
 
 		 159 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  34.25 
 
 		 156 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  34.25 
 
 		 156 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  32.26 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  32.35 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.87 
 
 		 164 aa  85.5  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  33.1 
 
 		 165 aa  85.1  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  29.73 
 
 		 164 aa  84.7  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  33.86 
 
 		 160 aa  84.7  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  27.16 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  29.05 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  29.45 
 
 		 165 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  29.05 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  31.17 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  29.05 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  29.05 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  27.52 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  29.05 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  27.52 
 
 		 159 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.86 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.05 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  28.86 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  28.86 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  29.05 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  28.86 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  29.05 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  29.05 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  34.4 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  29.17 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  31.68 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  29.17 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  27.7 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  27.16 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  32.39 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  28.3 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  26.85 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.97 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  26.14 
 
 		 165 aa  80.9  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.34 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  33.99 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  27.34 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  28.19 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  33.56 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  28.78 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  27.08 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  27.61 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  33.1 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  30.16 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  35.04 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  28.57 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  25 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  26.35 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  29.37 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  27.89 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  28.95 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  28.03 
 
 		 331 aa  79  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.73 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  35.24 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  31.97 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  28.17 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  28.86 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  31.3 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  36.57 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  31.29 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  28.03 
 
 		 165 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  31.29 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  25.87 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  32.75 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  25.52 
 
 		 164 aa  77.4  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  28.03 
 
 		 165 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  30.77 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  25.16 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.25 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.19 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  31.13 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  34.48 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  32.24 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  34.48 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  31.06 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  28.19 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  25.53 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  27.22 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3975  CheW protein  34.26 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000746819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  30.53 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  27.41 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  28.57 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  34.48 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  28.17 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  31.75 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  23.45 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>