More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3089 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 
306 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  91.83 
 
 
306 aa  577  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  89.54 
 
 
307 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  90.2 
 
 
306 aa  565  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  90.2 
 
 
306 aa  564  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  89.87 
 
 
306 aa  566  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  89.22 
 
 
306 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  89.54 
 
 
306 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  89.54 
 
 
306 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  89.54 
 
 
306 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  89.54 
 
 
306 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  89.87 
 
 
306 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  88.89 
 
 
306 aa  558  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  87.91 
 
 
306 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  87.25 
 
 
306 aa  547  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  85.62 
 
 
306 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  66.45 
 
 
306 aa  411  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  66.34 
 
 
306 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  63.84 
 
 
308 aa  401  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  63.58 
 
 
308 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  63.31 
 
 
308 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  63.84 
 
 
309 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  60.78 
 
 
316 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  60.33 
 
 
310 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  59.67 
 
 
310 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  57.91 
 
 
309 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  58.67 
 
 
308 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  58.67 
 
 
308 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  58.14 
 
 
309 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  56.67 
 
 
310 aa  358  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  58.14 
 
 
309 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  58.14 
 
 
309 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  58.14 
 
 
309 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  54.87 
 
 
310 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  57.95 
 
 
309 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  57.84 
 
 
310 aa  338  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  52.61 
 
 
310 aa  333  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  65.43 
 
 
248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  51.64 
 
 
308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  50 
 
 
311 aa  325  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  51.32 
 
 
308 aa  322  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  50.65 
 
 
311 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  50 
 
 
311 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
311 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  50 
 
 
311 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
311 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  48.06 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  48.38 
 
 
311 aa  311  6.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  52.15 
 
 
309 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  49.34 
 
 
313 aa  305  5.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  51.46 
 
 
338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
314 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
314 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
314 aa  300  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  49.35 
 
 
314 aa  296  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  49.35 
 
 
314 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  49.35 
 
 
314 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  50.64 
 
 
313 aa  296  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  49.35 
 
 
314 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  49.35 
 
 
314 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  49.03 
 
 
313 aa  295  8e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  48.38 
 
 
317 aa  294  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  48.7 
 
 
314 aa  292  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  50 
 
 
314 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  49.83 
 
 
314 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  49.68 
 
 
312 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  49.83 
 
 
314 aa  290  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  48.71 
 
 
314 aa  285  5e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  47.4 
 
 
313 aa  285  9e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  48.22 
 
 
314 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  47.77 
 
 
313 aa  278  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  48.41 
 
 
317 aa  276  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  48.6 
 
 
307 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  46.77 
 
 
324 aa  276  3e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  47.76 
 
 
319 aa  272  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  47.73 
 
 
314 aa  263  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  38.49 
 
 
322 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  40.77 
 
 
298 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  40.07 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4654  CheW protein  41.4 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  40.7 
 
 
308 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  39.65 
 
 
299 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  39.5 
 
 
295 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  39.15 
 
 
299 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  39.15 
 
 
299 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  38.97 
 
 
299 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  39.5 
 
 
299 aa  209  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  39.15 
 
 
299 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  38.79 
 
 
299 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  39.3 
 
 
299 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  39.25 
 
 
297 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  39.48 
 
 
312 aa  208  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  37.38 
 
 
316 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  37.38 
 
 
316 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  38.95 
 
 
314 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4384  response regulator receiver modulated CheW protein  40.48 
 
 
299 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.234409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  40 
 
 
299 aa  202  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  36.89 
 
 
313 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0498  putative chemotaxis protein, CheW-like  39.15 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.857231  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  37.7 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>