More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0388 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0388  CheW protein  100 
 
 		 154 aa  303  5.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  48.3 
 
 		 150 aa  140  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0275  putative CheW protein  45.7 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.18524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  41.22 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  40.27 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  39.86 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.01 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  35.92 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  38.35 
 
 		 183 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  34.03 
 
 		 167 aa  100  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  37.04 
 
 		 170 aa  100  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  35.66 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  33.99 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  35.66 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  32.88 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  36.55 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  36.55 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  39.29 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  36.62 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  37.41 
 
 		 160 aa  98.2  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  32.64 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  34.27 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  32.64 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  32.64 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  33.57 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  32.64 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  32.64 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  32.64 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  34.75 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  32.64 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  37.78 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  34.53 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  34.27 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  34.27 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  34.23 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  34.23 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  37.5 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  34.23 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  34.23 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  34.23 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  34.23 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  34.23 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  34.23 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  34.81 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  34.29 
 
 		 171 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  34.46 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  34.46 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  34.46 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  31.94 
 
 		 175 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  34.46 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  32.86 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  34.51 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  34.46 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1589  purine-binding chemotaxis protein  34.03 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0585533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  34.62 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  35.97 
 
 		 187 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  31.97 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  34.27 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  35.14 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  32.86 
 
 		 159 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  32.86 
 
 		 159 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  32.86 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  32.86 
 
 		 159 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  38.03 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  32.86 
 
 		 159 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  33.11 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  31.29 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  33.8 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  34.9 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  35.82 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  35.92 
 
 		 165 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  35.92 
 
 		 165 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  30.61 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  29.93 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  35.92 
 
 		 165 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.61 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  31.43 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  30.61 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  30.61 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  30.61 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  32.19 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  30.82 
 
 		 171 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  30.82 
 
 		 174 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  31.91 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  30.82 
 
 		 178 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  38.84 
 
 		 158 aa  93.6  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  32.14 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  30.61 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  31.91 
 
 		 167 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  37.76 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  31.58 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  32.14 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  31.62 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  38.84 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  30.61 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  35.07 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  35.07 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  32.14 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  30.61 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.61 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>