More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4311 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4311  chemotaxis protein  100 
 
 		 164 aa  323  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  72.15 
 
 		 160 aa  240  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  70.89 
 
 		 158 aa  232  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0616  CheW protein  59.51 
 
 		 163 aa  191  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1402  CheW protein  51.63 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.713319  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  47.44 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  47.44 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  40.99 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7835  chemotaxis protein cheW  44.52 
 
 		 162 aa  140  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4670  CheW protein  42.41 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.913092  normal  0.785076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6732  CheW protein  43.06 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0258565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  42.36 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  40 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  41.33 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  40.67 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.89 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  41.67 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  37.18 
 
 		 162 aa  117  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  37.5 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  36.08 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  39.33 
 
 		 179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.58 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.58 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.44 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  39.33 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  34.81 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  37.66 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  39.44 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  38.22 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  37.5 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  34.23 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7838  CheW protein  35.06 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  38.03 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  39.74 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  39.19 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  34.9 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  35.17 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  36.49 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  38.51 
 
 		 185 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  39.16 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  37.32 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  37.32 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  39.16 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4315  chemotaxis protein  33.55 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0365627  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.62 
 
 		 174 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  36.77 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0144  CheW protein  34.48 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.675367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  37.75 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  32.3 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3263  CheW protein  33.99 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.21 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6736  CheW protein  35.97 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  34.51 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  34.21 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  34.21 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  34.21 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  34.72 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4675  CheW protein  36.69 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  33.12 
 
 		 187 aa  97.8  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  38.36 
 
 		 178 aa  97.1  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  33.12 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  37.76 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  38.36 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  32.89 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0620  CheW protein  36.67 
 
 		 212 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0159929 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  33.33 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  33.1 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  35.81 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  36.31 
 
 		 192 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  33.1 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3562  CheW protein  34.27 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  36.31 
 
 		 194 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  31.13 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  32.89 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4816  CheW protein  34.93 
 
 		 189 aa  94.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  34.51 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  33.33 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0613  CheW protein  35.37 
 
 		 175 aa  94.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  34.46 
 
 		 163 aa  94.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  33.1 
 
 		 161 aa  94.4  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  33.1 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  35.03 
 
 		 194 aa  94.4  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 164 aa  94  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  34.23 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  31.58 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  31.58 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  33.11 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  32.88 
 
 		 184 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  33.1 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  33.1 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0266  putative CheW protein  37.23 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719824  normal  0.452082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  32.21 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>