24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3083 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  100 
 
 		 154 aa  307  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  72.73 
 
 		 158 aa  227  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  61.69 
 
 		 156 aa  193  9e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  61.44 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  30.14 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  34.78 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  34.78 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  32.03 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0360  chemosensory pili system protein ChpC  31.33 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0250282  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  33.8 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  33.33 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  31.69 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  29.33 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  34.78 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  34.78 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  34.78 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  27.34 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  32.61 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  24.49 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0993  CheW protein  31.34 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165537  normal  0.34586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  28.71 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  28.05 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  30 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2395  hypothetical protein  26.32 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.787509  normal  0.666483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>