20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5303 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  67.11 
 
 		 156 aa  203  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  65.77 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  58.22 
 
 		 156 aa  174  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  59.74 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  59.74 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  59.74 
 
 		 157 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  59.74 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  57.93 
 
 		 168 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  57.93 
 
 		 168 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  36.67 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  36.89 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  33.06 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  31.69 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  33.03 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  27.46 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  27.46 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0360  chemosensory pili system protein ChpC  27.66 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0250282  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0519  hypothetical protein  25.76 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>