20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_05410 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  100 
 
 
168 aa  327  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  95.24 
 
 
168 aa  277  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  64.56 
 
 
156 aa  192  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  59.87 
 
 
156 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  59.87 
 
 
156 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  57.53 
 
 
155 aa  167  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  55.17 
 
 
153 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  55.86 
 
 
157 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  55.86 
 
 
157 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  55.86 
 
 
157 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  34.48 
 
 
153 aa  90.9  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  34.97 
 
 
185 aa  84.3  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  36.8 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  33.33 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0360  chemosensory pili system protein ChpC  31.51 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0250282  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  30.56 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  30.56 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  30.56 
 
 
156 aa  61.6  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  29.45 
 
 
155 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0519  hypothetical protein  25.66 
 
 
190 aa  52  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>