19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0410 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  100 
 
 		 156 aa  300  5.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  64.56 
 
 		 168 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  60.65 
 
 		 156 aa  178  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  60 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  58.22 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  62.5 
 
 		 168 aa  173  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  55.48 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  54.84 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  54.84 
 
 		 157 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  52.9 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  41.94 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  34.46 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  31.94 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  33.8 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  33.81 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  32.38 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  27.97 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  27.97 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0360  chemosensory pili system protein ChpC  32.39 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0250282  normal  0.935785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>