20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3627 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  39.6 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  37.93 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  39.26 
 
 		 168 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  39.26 
 
 		 168 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  35.46 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  35.21 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  35.21 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  35.92 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  34.51 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  32.41 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  33.8 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  29.45 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  31.78 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  30.88 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  24.5 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0360  chemosensory pili system protein ChpC  31.16 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0250282  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  24.09 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  24.22 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0519  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>