12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0519 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0519  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  387  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  21.23 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  25.66 
 
 
168 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  22.07 
 
 
153 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  27.01 
 
 
168 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  29.45 
 
 
157 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  29.45 
 
 
157 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  29.41 
 
 
160 aa  44.7  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  32.69 
 
 
153 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  28.77 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  25.76 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  26.92 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>