19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4987 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  100 
 
 		 157 aa  307  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  99.36 
 
 		 157 aa  306  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  98.73 
 
 		 157 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  92.81 
 
 		 153 aa  280  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  62.5 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  59.74 
 
 		 155 aa  166  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  59.06 
 
 		 156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  54.84 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  55.86 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  55.17 
 
 		 168 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  33.77 
 
 		 153 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  33.87 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  33.56 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  34.78 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  30.91 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  32.98 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  28.57 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  28.57 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0519  hypothetical protein  29.45 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>