19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5029 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  309  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  93.59 
 
 		 156 aa  291  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  67.11 
 
 		 155 aa  203  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  60 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  63.89 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  62.5 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  62.5 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  62.5 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  59.87 
 
 		 168 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  58.6 
 
 		 168 aa  150  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  39.31 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  34.06 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  34.78 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  33.87 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  34.62 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  31.88 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  29.37 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  29.37 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0360  chemosensory pili system protein ChpC  29.66 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0250282  normal  0.935785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>