15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0360 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0360  chemosensory pili system protein ChpC  100 
 
 
186 aa  361  4e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0250282  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  29.14 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  29.14 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  27.78 
 
 
185 aa  71.2  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  31.33 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  31.01 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  30.14 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  28.74 
 
 
168 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  31.97 
 
 
155 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  30.37 
 
 
160 aa  58.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  31.06 
 
 
153 aa  55.5  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  31.03 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  29.66 
 
 
156 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  32.39 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  27.66 
 
 
155 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>