20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0898 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  99.36 
 
 		 156 aa  316  9e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  69.86 
 
 		 158 aa  210  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  61.44 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0360  chemosensory pili system protein ChpC  29.14 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0250282  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  29.79 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  25.34 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  30.56 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  27.46 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  29.37 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  27.97 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  29.29 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  23.61 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  24.26 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  28.57 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  28.57 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  28.57 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  24.49 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  27.63 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2395  hypothetical protein  22.3 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.787509  normal  0.666483 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>