21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3774 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  100 
 
 
153 aa  312  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  39.31 
 
 
156 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  40 
 
 
156 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  36.67 
 
 
155 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  34.46 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  37.93 
 
 
160 aa  87.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  34.48 
 
 
168 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  32.89 
 
 
153 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  34.93 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  33.77 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  33.11 
 
 
157 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  32.89 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  32 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  30.92 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  27.34 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  26.21 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0360  chemosensory pili system protein ChpC  31.06 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0250282  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  24.49 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  24.49 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0519  hypothetical protein  22.07 
 
 
190 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0056  CheW protein  25.88 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>