30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2899 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2899  putative CheW protein  100 
 
 		 155 aa  313  5e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2395  hypothetical protein  37.25 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.787509  normal  0.666483 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3774  putative CheW protein  30.92 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5029  hypothetical protein  34.62 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3627  putative chemotaxis protein  29.45 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.932424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0493  CheW-like protein  34.62 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0124  CheW-like protein  28.1 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5303  CheW protein  33.03 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0509763  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01609  hypothetical protein  26.06 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0410  putative CheW protein  32.38 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05410  putative chemotaxis protein  29.45 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.971364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0898  CheW protein  25.34 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1022  putative chemotaxis protein  25.34 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0515  putative chemotaxis protein  32.04 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4987  CheW domain protein  30.91 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0360  chemosensory pili system protein ChpC  31.97 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0250282  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4861  CheW domain-containing protein  30.91 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0149228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5037  CheW domain-containing protein  30 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0477  CheW domain-containing protein  28.18 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3083  CheW protein  24.49 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245623  normal  0.222327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  29.13 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2532  CheW protein  24.07 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  27.59 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  28.57 
 
 		 184 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  36.84 
 
 		 185 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1832  CheW protein  25.9 
 
 		 184 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0194575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5394  CheW protein  35.48 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.401172 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3652  CheW protein  29.23 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0323025  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  29.11 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  37.93 
 
 		 212 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>