More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1832 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1832  CheW protein  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0194575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  34.09 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.65 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  35.65 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  35.65 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  35.65 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  32.39 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  36.94 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  32.59 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  35.65 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  31.21 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  32.47 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  34.78 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  34.78 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  34.78 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  33.91 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.71 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.04 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.71 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  33.91 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  34.78 
 
 		 159 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  31.43 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  33.09 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  34.38 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  28.57 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  33.33 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.36 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  31.36 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  31.36 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  31.36 
 
 		 164 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  32.71 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  31.09 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  32.71 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  32.71 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  32.71 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  31.33 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  31.15 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  30.25 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1529  CheW protein  34.15 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.205941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  33.33 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  32.14 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  29.41 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  32.71 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  31.48 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  30 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  28.99 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  31.48 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  26.97 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  30.56 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  30.25 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.36 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  31.06 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  27.61 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  31.82 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  29.92 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  32.76 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0751  CheW protein  28.37 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  27.43 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  31.06 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  30 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  31.65 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  28.95 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  28.95 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  33.08 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  30.37 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  33.58 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.91 
 
 		 163 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  28.7 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  32.84 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.97 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  33.33 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  30.34 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  30.99 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  29.41 
 
 		 479 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  31.45 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  27.59 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  27.83 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  33.04 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  30 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  31.71 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  30.28 
 
 		 165 aa  52  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  30.33 
 
 		 147 aa  51.6  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  35.96 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  30.28 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  30.28 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  30.58 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  29.35 
 
 		 161 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  32.14 
 
 		 165 aa  51.6  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0090  CheW protein  25.47 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  28.23 
 
 		 218 aa  51.2  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  31.62 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  32.56 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  31.69 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  29.75 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  32.48 
 
 		 238 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  31.69 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  29.01 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  30.88 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  27.52 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>