More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0357 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  40.8 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  33.89 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  36.31 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  39.08 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  39.08 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  39.08 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  39.08 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  32.78 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  37.93 
 
 		 178 aa  104  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  37.36 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  31.67 
 
 		 181 aa  94.7  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  32.76 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  31.43 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  32.24 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  30.34 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  32.24 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  31.21 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  31.21 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  30.77 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  31.85 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  39.84 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  36.21 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  33.14 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  38.54 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  39.39 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  39.39 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  35.79 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  38.04 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  33.83 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  32.5 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  27.68 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  37.93 
 
 		 518 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  42.5 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  36.67 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  28.05 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  27.7 
 
 		 478 aa  65.5  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  32.85 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  31.67 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  36.72 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  34.21 
 
 		 176 aa  64.3  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  28.87 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  33.61 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  36.67 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  29.58 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  35.48 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  32.77 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  34.65 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  29.37 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  37.23 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  28.67 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  37.23 
 
 		 306 aa  62  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  37.23 
 
 		 306 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  37.23 
 
 		 306 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  26.61 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  37.23 
 
 		 306 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  37.23 
 
 		 306 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  37.23 
 
 		 306 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  37.23 
 
 		 306 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  37.23 
 
 		 306 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.4 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  34.59 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  32.56 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.97 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  31.97 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  30.95 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  31.97 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  37.23 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  36.17 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  31.97 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  36.17 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  35.09 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  31.97 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  30.36 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  34.48 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  35.11 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  32.65 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  34.92 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.93 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  26.95 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  31.97 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  25.95 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  28.57 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.93 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.93 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  30.3 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  31.5 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  26.24 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.75 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  29.75 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  29.75 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  29.75 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  29.55 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  26.24 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  32.29 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  31.58 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  38.1 
 
 		 307 aa  57.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  29.75 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  28.43 
 
 		 344 aa  57.8  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4129  CheW protein  33.88 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.282724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>