More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3769 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  51.4 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  51.4 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  51.67 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  44.94 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  46.11 
 
 		 179 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  45.98 
 
 		 184 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  45.36 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  44.51 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  45.09 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  44.69 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  44.83 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  40.23 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  40.23 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  40.11 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  38.36 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  31.76 
 
 		 178 aa  110  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  32.22 
 
 		 183 aa  97.4  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  31.61 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  31.61 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  30.86 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  32.12 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  32.12 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  32.2 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  32.28 
 
 		 146 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  28.06 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  27.59 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  27.5 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  26 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.17 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  31.86 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  28.74 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  25.61 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  33 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.36 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  26.19 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  32.32 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  26.57 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.97 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  34.96 
 
 		 568 aa  61.6  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  27.73 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.24 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  24.54 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  24.24 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  24.24 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  24.24 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  28.33 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  24.54 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  24.54 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  24.54 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  24.54 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.15 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  24.83 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  23.93 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  35 
 
 		 444 aa  59.3  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.62 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  23.64 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  30.71 
 
 		 520 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.62 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.62 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  25.53 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  25.32 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  23.53 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  29.37 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.67 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  29.09 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  24.1 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  24.32 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  27.63 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  26.55 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  30.1 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  25 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  28.57 
 
 		 167 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  32.94 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  34.62 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  24.32 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  24.65 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  29.63 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  30.08 
 
 		 531 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  23.4 
 
 		 478 aa  56.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  31.16 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  26.96 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  23.84 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  29.58 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  35.87 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.71 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  32.32 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0046  CheW protein  32.74 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00918477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  27.89 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  30.77 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1681  putative CheW protein  32.74 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0157422  hitchhiker  0.0044315 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  23.08 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  27.19 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  31.86 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  21.84 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  23.53 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  32.69 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  31.07 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  32.04 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  23.48 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>