More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1816 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  100 
 
 		 176 aa  364  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  94.89 
 
 		 176 aa  349  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  43.58 
 
 		 179 aa  160  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  38.95 
 
 		 181 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  44.59 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  43.92 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  41.04 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  43.84 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  40.68 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  38.82 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  43.15 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  43.15 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  32.57 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  42.47 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  40.82 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  36.24 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  33.12 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  32.24 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  30.34 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  30.34 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  31.72 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  33.56 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  34.31 
 
 		 478 aa  71.6  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  34.91 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  28.68 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  36.73 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  24.62 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  29.59 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  32.23 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  28.21 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  39.08 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  31.62 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  30.08 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  37.25 
 
 		 515 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  28.3 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  33.01 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  27.1 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  30.19 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  32.67 
 
 		 301 aa  57  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  31.63 
 
 		 568 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  27.36 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  27.95 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  32.61 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  26.61 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  30.16 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  27.95 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  29.29 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  24.75 
 
 		 466 aa  55.1  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  29.36 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  26.21 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  30.77 
 
 		 518 aa  55.1  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0138  putative CheW protein  30 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0706424  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0218  putative CheW protein  30 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  26.37 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  31.11 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  30.53 
 
 		 326 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  28.71 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  28.71 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  26.47 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  27.45 
 
 		 444 aa  53.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  25.96 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  28.57 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  25 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  30.53 
 
 		 326 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  30 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  30.95 
 
 		 326 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  30.53 
 
 		 326 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  29.36 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  29.36 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  27.18 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  30.53 
 
 		 326 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.21 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  30.53 
 
 		 326 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  34.57 
 
 		 342 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  34.57 
 
 		 326 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  25 
 
 		 168 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  30 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  27.68 
 
 		 324 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  27.64 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  34.57 
 
 		 328 aa  52.4  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  24.8 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  30.28 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0995  putative CheW protein  30.77 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  28.57 
 
 		 137 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  27.64 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  25 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  32.97 
 
 		 344 aa  51.2  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  26.45 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  29.66 
 
 		 174 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  26 
 
 		 136 aa  50.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  32.95 
 
 		 336 aa  50.8  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  23.01 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0039  putative CheW protein  27.36 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  28.24 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  30.34 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  23.3 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  26.09 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  30.69 
 
 		 309 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  27.1 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  26 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>