134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3746 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  100 
 
 
174 aa  345  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  64.41 
 
 
176 aa  217  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  60.8 
 
 
176 aa  215  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  63.64 
 
 
175 aa  214  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  60.98 
 
 
176 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  60.98 
 
 
176 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  57.71 
 
 
172 aa  197  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  40 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  33.33 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  29.41 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  32.79 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  32.79 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  36.97 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  35.37 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  30.88 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  29.58 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  32.14 
 
 
528 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  38.3 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  37.78 
 
 
568 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  31.36 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  29.55 
 
 
141 aa  51.2  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  29.66 
 
 
176 aa  51.2  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  34.04 
 
 
779 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  27.08 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  27.35 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  28.36 
 
 
182 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  28.81 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  29.76 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  36.36 
 
 
137 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  26.61 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1768  CheW protein  29.23 
 
 
514 aa  48.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110635 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  29.07 
 
 
331 aa  47.8  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  27.91 
 
 
308 aa  47.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  43.75 
 
 
137 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  23.87 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0691  putative CheW protein  37.84 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  42.86 
 
 
141 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  26.8 
 
 
314 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  28.71 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  29.41 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  29.41 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  29.13 
 
 
299 aa  45.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  33.33 
 
 
183 aa  45.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  31.62 
 
 
149 aa  45.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4744  CheW protein  27.27 
 
 
175 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001523 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  44.26 
 
 
137 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  41.67 
 
 
479 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  44.26 
 
 
137 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  28.07 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  32.05 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.11 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  28.68 
 
 
295 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  33.33 
 
 
149 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  29.76 
 
 
146 aa  45.1  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  27.74 
 
 
164 aa  45.1  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00029  chemotaxis protein  37.5 
 
 
340 aa  44.7  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.377111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.17 
 
 
164 aa  44.3  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.47 
 
 
174 aa  44.3  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  35.64 
 
 
344 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  30.47 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  33 
 
 
317 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  28.16 
 
 
299 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  30.43 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  30.88 
 
 
301 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  29.08 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  30.41 
 
 
314 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0320  CheW protein  33.78 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  35.56 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  28.85 
 
 
907 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  29.29 
 
 
312 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  35.56 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0265  putative CheW protein  33.68 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0932  putative CheW protein  36.23 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.432309  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  28.57 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  35.44 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  36.59 
 
 
316 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1855  CheW protein  41.82 
 
 
429 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0150671  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  29.79 
 
 
444 aa  42.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  27.61 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  32.71 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  28.33 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  31.37 
 
 
175 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  31.37 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  27.61 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  28.57 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  29.69 
 
 
154 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  29.63 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  28.57 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  29.2 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  28.57 
 
 
164 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  28.99 
 
 
141 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  30.38 
 
 
205 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  30.47 
 
 
156 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  33.07 
 
 
157 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  27.83 
 
 
151 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  28.16 
 
 
298 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  26.02 
 
 
298 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  28.47 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  30.47 
 
 
156 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>