77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1768 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1768  CheW protein  100 
 
 		 514 aa  991    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2442  CheW domain protein  26.09 
 
 		 487 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2215  CheW-like protein  26.63 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3593  CheW protein  27.93 
 
 		 521 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.599769  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  22.34 
 
 		 528 aa  83.2  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  17.47 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3197  CheW protein  35.04 
 
 		 158 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.37318 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  22.11 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  31.3 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  41.05 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  29.32 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  29.77 
 
 		 175 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  26.02 
 
 		 568 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  30.88 
 
 		 172 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  28.97 
 
 		 179 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  26.51 
 
 		 479 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0995  putative CheW protein  30.15 
 
 		 146 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  38.82 
 
 		 155 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  21.1 
 
 		 515 aa  51.2  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  31.07 
 
 		 159 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  28.78 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  20.09 
 
 		 518 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  28.07 
 
 		 159 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  29.23 
 
 		 174 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  31.78 
 
 		 161 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  22.8 
 
 		 533 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  31.48 
 
 		 153 aa  48.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  29.79 
 
 		 176 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  26.24 
 
 		 189 aa  47.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  24.84 
 
 		 174 aa  47.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  28.04 
 
 		 167 aa  47.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1586  chemotaxis protein, CheW3  34.81 
 
 		 178 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  33.02 
 
 		 166 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  33.02 
 
 		 166 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  33 
 
 		 164 aa  47  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0238  putative CheW protein  34.81 
 
 		 178 aa  47  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  29.79 
 
 		 176 aa  47  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  33.7 
 
 		 194 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  24.14 
 
 		 331 aa  46.6  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  28.79 
 
 		 176 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  37.66 
 
 		 137 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  29.76 
 
 		 336 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  28.79 
 
 		 176 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  28.57 
 
 		 165 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  37.66 
 
 		 137 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.03 
 
 		 164 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  27.17 
 
 		 307 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2918  CheW protein  33.55 
 
 		 301 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00571645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  26.85 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  26.85 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  29.2 
 
 		 161 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  26.85 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  29.91 
 
 		 158 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  26.85 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  32 
 
 		 316 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.37 
 
 		 165 aa  45.1  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  32.61 
 
 		 194 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  30.5 
 
 		 160 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  26.87 
 
 		 176 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  30.77 
 
 		 179 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  32.61 
 
 		 194 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2826  CheW protein  32.68 
 
 		 302 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0351832  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1634  putative CheW protein  28.7 
 
 		 170 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.443823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  25.66 
 
 		 218 aa  43.9  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  38.03 
 
 		 164 aa  43.5  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  27.52 
 
 		 136 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  31.58 
 
 		 779 aa  43.5  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  28.32 
 
 		 161 aa  43.5  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  33.04 
 
 		 169 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  26.76 
 
 		 326 aa  43.5  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  27.12 
 
 		 139 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  36.62 
 
 		 164 aa  43.5  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  36.62 
 
 		 164 aa  43.1  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  31.54 
 
 		 185 aa  43.5  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  28.83 
 
 		 162 aa  43.5  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.89 
 
 		 164 aa  43.5  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>