189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0721 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  100 
 
 
176 aa  352  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  100 
 
 
176 aa  352  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  73.56 
 
 
176 aa  270  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  60.23 
 
 
176 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  58.52 
 
 
175 aa  208  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  60.98 
 
 
174 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  58.86 
 
 
172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  38 
 
 
160 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  31.9 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  27.84 
 
 
180 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  27.84 
 
 
180 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  38.83 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  38.83 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  29.27 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  38.83 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  33.8 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  29.27 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  30.15 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  33.8 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  28.78 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  31.65 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  31.4 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  28.57 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  30.58 
 
 
159 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  28.35 
 
 
169 aa  58.2  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  38.83 
 
 
154 aa  58.2  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  28 
 
 
157 aa  57.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.78 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.58 
 
 
164 aa  57.8  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  28.78 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  28.78 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  28.78 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 
174 aa  57.4  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  30.22 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.88 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.28 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  30.88 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  30.88 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  30.88 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  30.88 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  30.22 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  30.88 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  30.22 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  30.22 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  30.37 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.68 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.88 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  28.06 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  28.06 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  27.59 
 
 
191 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  32.04 
 
 
159 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  32.99 
 
 
779 aa  54.7  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  29.71 
 
 
163 aa  54.3  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  30.37 
 
 
163 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  30.37 
 
 
161 aa  54.3  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  29.63 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  27.94 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  30.37 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  29.63 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  28.99 
 
 
164 aa  52.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  28.87 
 
 
528 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.05 
 
 
153 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  30.1 
 
 
299 aa  52  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  30.1 
 
 
158 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  26.53 
 
 
159 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  24.81 
 
 
159 aa  52  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  27.94 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  30.1 
 
 
158 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  28.78 
 
 
150 aa  51.2  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  29.13 
 
 
299 aa  51.2  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  28.16 
 
 
299 aa  50.8  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  33.87 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  26.12 
 
 
298 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  30.1 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  26.32 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  28.16 
 
 
299 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  28.16 
 
 
299 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  33.01 
 
 
157 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  30.3 
 
 
331 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  27.18 
 
 
298 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  26.12 
 
 
298 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  26.12 
 
 
298 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2408  CheW protein  45.07 
 
 
152 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.492759  normal  0.123205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  22.07 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  30.49 
 
 
141 aa  48.5  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  25.87 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  26.05 
 
 
300 aa  48.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  30 
 
 
152 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  31.07 
 
 
141 aa  47.8  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  28.57 
 
 
299 aa  47.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  38.24 
 
 
301 aa  47.8  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  25.24 
 
 
298 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  31.51 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  28.21 
 
 
155 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  29.29 
 
 
568 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2527  CheW-like protein  28.16 
 
 
297 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  25.23 
 
 
161 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  30.22 
 
 
189 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  31.58 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  27.69 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>