More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2527 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2527  CheW-like protein  100 
 
 
297 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  80.82 
 
 
299 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  80.82 
 
 
299 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  80.14 
 
 
299 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  79.73 
 
 
299 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  79.11 
 
 
300 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  78.77 
 
 
299 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  78.08 
 
 
298 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  78.08 
 
 
298 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  78.08 
 
 
298 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  78.08 
 
 
298 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  74.75 
 
 
298 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  75.77 
 
 
295 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  76.71 
 
 
314 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  74.91 
 
 
308 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  70.57 
 
 
299 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001360  chemotaxis protein CheV  61.3 
 
 
304 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0285  putative chemotaxis protein CheV  61.09 
 
 
306 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116334  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05250  chemotaxis protein CheV  61.99 
 
 
304 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0498  putative chemotaxis protein, CheW-like  61.64 
 
 
302 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.857231  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3396  putative CheW protein  57.39 
 
 
295 aa  345  6e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  37.37 
 
 
306 aa  202  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  37.72 
 
 
306 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  38.03 
 
 
309 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  38.35 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  37.01 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  37.28 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  37.01 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  37.94 
 
 
310 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  37.28 
 
 
299 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  37.46 
 
 
306 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  37.46 
 
 
306 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  37.46 
 
 
306 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  37.46 
 
 
306 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  36.65 
 
 
306 aa  199  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  37.28 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  36.1 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  36.4 
 
 
306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  36.3 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  37.55 
 
 
316 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  37.81 
 
 
338 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  35.74 
 
 
309 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  36.18 
 
 
298 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  37.01 
 
 
306 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  36.46 
 
 
310 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  37.18 
 
 
310 aa  192  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  35.17 
 
 
310 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  37.01 
 
 
307 aa  192  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4654  CheW protein  37.02 
 
 
300 aa  192  6e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  35.74 
 
 
309 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4384  response regulator receiver modulated CheW protein  36.84 
 
 
299 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.234409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  37.01 
 
 
306 aa  191  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  37.02 
 
 
311 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  35.74 
 
 
309 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  36.59 
 
 
314 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  35.74 
 
 
309 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  36.52 
 
 
314 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  36.17 
 
 
314 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  37.32 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  36.59 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  36.59 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  36.17 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  36.59 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  36.23 
 
 
312 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  36.17 
 
 
317 aa  189  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  36.59 
 
 
314 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  35.23 
 
 
306 aa  188  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  35.97 
 
 
310 aa  188  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  36.17 
 
 
314 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  35.74 
 
 
308 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  35.74 
 
 
308 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  36.65 
 
 
306 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  35.69 
 
 
308 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  36.2 
 
 
311 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  36.56 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  36.3 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  34.88 
 
 
307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  35.62 
 
 
308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  35.09 
 
 
313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  36.56 
 
 
308 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  35.07 
 
 
310 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  35.19 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  34.04 
 
 
314 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  34.06 
 
 
314 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  35.38 
 
 
311 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  34.62 
 
 
306 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  37.89 
 
 
314 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  37.89 
 
 
314 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  34.57 
 
 
309 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  36.17 
 
 
309 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  33.69 
 
 
313 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  34.04 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  34.77 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  34.77 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  37.76 
 
 
314 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  34.77 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  32.54 
 
 
324 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  34.77 
 
 
311 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  33.57 
 
 
313 aa  170  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  31.47 
 
 
313 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>