196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1016 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  100 
 
 		 160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  38.93 
 
 		 175 aa  117  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  40 
 
 		 174 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  38.67 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  38 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  38 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  38 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  35.57 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  32.67 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  35 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4744  CheW protein  33.05 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  32.28 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  36.92 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  30.77 
 
 		 528 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  32.65 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  32.23 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4018  CheW protein  26.36 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4056  CheW protein  26.36 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  24.65 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  23.94 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  25 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  25.53 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  26.39 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  25.77 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  29.66 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  26.03 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  25.17 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  30.65 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  30.77 
 
 		 478 aa  53.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  40.24 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  27.35 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  30.47 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  40.24 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  29.88 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  30.47 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  30.47 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2361  CheW protein  30.83 
 
 		 342 aa  51.6  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  28.57 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  25.95 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1769  CheW protein  26.62 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  31.71 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  27.78 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.69 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  28.3 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  29.69 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.84 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  25.34 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  25.34 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  28.47 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  25.97 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.81 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.7 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  25.55 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  26.14 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  27.87 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  25.97 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  32.29 
 
 		 515 aa  48.5  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  30.51 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  25.55 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  32.69 
 
 		 200 aa  48.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  30.36 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  29.75 
 
 		 199 aa  48.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2527  CheW-like protein  25 
 
 		 297 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  24.84 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  32.69 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  24.68 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  27.73 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  33.33 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  29.91 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.51 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.51 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.49 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  28.81 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  25.49 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  25.49 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  25.49 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  28.57 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  26.67 
 
 		 189 aa  47.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  27.43 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  26.39 
 
 		 168 aa  47.4  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.05 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  25.55 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  31.03 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  25.55 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  43.08 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  25.55 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  26.92 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  24.05 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  25.55 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  25.36 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  24.05 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  24.05 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  27.1 
 
 		 568 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  32.04 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  24.83 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  25.55 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  27.27 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  27.1 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  26.85 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  27.27 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>