More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4318 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_4318  CheW protein  100 
 
 		 137 aa  251  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.450295  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4473  CheW protein  97.08 
 
 		 137 aa  220  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4454  CheW protein  97.08 
 
 		 137 aa  220  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  78.83 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2148  CheW protein  32 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0798486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  36.46 
 
 		 182 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  33.83 
 
 		 177 aa  62  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  31.37 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  33.08 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  32.71 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  35.4 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  34.17 
 
 		 531 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  32.9 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  35.14 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  36.63 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  26.81 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  28.26 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  36.63 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  28.26 
 
 		 306 aa  57.4  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  41.67 
 
 		 184 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  34.83 
 
 		 189 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  41.67 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  40.62 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  41.67 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  37.36 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.69 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  38.78 
 
 		 568 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  37.36 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  26.81 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  35.16 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  36.84 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  34.23 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  30.91 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  37.36 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  32.74 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  31.5 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  27.54 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  35.16 
 
 		 518 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.26 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  32.41 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  36.26 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  36.26 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.26 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  36.26 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  32.41 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  26.87 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  33.64 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  26.76 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.77 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  33.01 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  26.28 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  28.57 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  37.08 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  37.11 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  35.16 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3317  CheW protein  31.29 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  36.04 
 
 		 533 aa  54.3  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  36.26 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  40.82 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  28.28 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  35.64 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  24.44 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  31.63 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  26.81 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  36.21 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  32.67 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  34.07 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.23 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  43.55 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  31.3 
 
 		 779 aa  53.9  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  29.37 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  40.62 
 
 		 212 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  26.81 
 
 		 306 aa  52.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  35.16 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3074  CheW protein  42.16 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.442292  hitchhiker  0.00529437 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  31.47 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  43.3 
 
 		 212 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  40.45 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  29.57 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  26.81 
 
 		 306 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  29.71 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  29.71 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  26.81 
 
 		 306 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  26.61 
 
 		 313 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  26.81 
 
 		 306 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  26.81 
 
 		 306 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  33.33 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.09 
 
 		 164 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  50 
 
 		 479 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  26.53 
 
 		 515 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  28.26 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  31.68 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  30.69 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  32.35 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  25.74 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  32.35 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  26.81 
 
 		 306 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  26.81 
 
 		 306 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>