230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2788 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  61.54 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  61.54 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  41.86 
 
 		 191 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  37.18 
 
 		 157 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4056  CheW protein  30.3 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4018  CheW protein  30.3 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  33.33 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  31.95 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  32.68 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  31.9 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  31.9 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  29.87 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  29.01 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  30.67 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  30.32 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  30.25 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  29.68 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0716  CheW protein  26.99 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  27.45 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  29.49 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  25.82 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  26.22 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  26.83 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4744  CheW protein  29.56 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  26.35 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.09 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  26.09 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  26.09 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.1 
 
 		 174 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  26.09 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  26.45 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  26.45 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  26.28 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  31.97 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  28.23 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  30.12 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  24.05 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  24.64 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  24.46 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  30.58 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  26.83 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  28.93 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  26.83 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  29.13 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  37.97 
 
 		 528 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  29.05 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  25.36 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  24.49 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  25.36 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  26.02 
 
 		 159 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  24.56 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.65 
 
 		 164 aa  51.6  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  31.9 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  26.92 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  27.56 
 
 		 140 aa  51.2  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  24.24 
 
 		 161 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  29.66 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  29.66 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  25 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  23.26 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1871  CheW protein  32.03 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  26.4 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  27.41 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.97 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  26.79 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  27.42 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  22.97 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  23.9 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  22.97 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  22.97 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1832  CheW protein  32.48 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0194575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  22.97 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  22.84 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  22.49 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  27.42 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  23.46 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  22.67 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  22.97 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  24.67 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  25.56 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  25 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  23.74 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  23.74 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  25.15 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  31 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  24.31 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  23.74 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  26.83 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  31 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  23.74 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  26.22 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  27.92 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  27.59 
 
 		 325 aa  48.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  27.21 
 
 		 518 aa  48.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  24.63 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  24.49 
 
 		 308 aa  47.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  28.92 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  33.6 
 
 		 154 aa  47.8  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  29.57 
 
 		 155 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>