67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0716 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0716  CheW protein  100 
 
 		 160 aa  323  5e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  29.53 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  26.88 
 
 		 180 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  26.88 
 
 		 180 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  26.17 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  26.99 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4018  CheW protein  24.38 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4056  CheW protein  24.38 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  26.28 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  27.59 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  22.92 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  29.66 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  27.43 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  29.2 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  30.39 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.37 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  31.37 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  31.37 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  31.37 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  30.39 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  28.81 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  22.76 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  29.41 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  30.39 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.17 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  29.41 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  29.2 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  30.39 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  28.87 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  27.43 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  27.43 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  29.17 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  27.87 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  31.65 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  29.09 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.55 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  29.47 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  28.72 
 
 		 218 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  27.18 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  26.09 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  23.53 
 
 		 172 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  26.23 
 
 		 161 aa  43.9  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  25.66 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.66 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  25.66 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  26.23 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  25.66 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  26.92 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  25.66 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  25.66 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0869  CheW protein  23.42 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  20.95 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  27.83 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  25.66 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  25.66 
 
 		 164 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  25.66 
 
 		 164 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  25.66 
 
 		 164 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  24.24 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  22.48 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  24.78 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  25.66 
 
 		 164 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  23.36 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  23.53 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  23.89 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  25 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  26.03 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  23.96 
 
 		 177 aa  40.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>