119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2215 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2442  CheW domain protein  91.7 
 
 		 487 aa  902    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2215  CheW-like protein  100 
 
 		 492 aa  997    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  25.4 
 
 		 528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1768  CheW protein  26.76 
 
 		 514 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110635 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  21.26 
 
 		 478 aa  92.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1014  putative purine-binding chemotaxis protein CheW  24.78 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  25.22 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  21.12 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  24.38 
 
 		 531 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3593  CheW protein  22.86 
 
 		 521 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.599769  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  20.89 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2322  CheW protein  22.79 
 
 		 533 aa  60.1  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0957  putative CheW protein  24.35 
 
 		 169 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000304707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  35.79 
 
 		 165 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  35.79 
 
 		 165 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  35.79 
 
 		 165 aa  55.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  35.11 
 
 		 166 aa  53.9  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3304  CheW protein  23.95 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  32.94 
 
 		 179 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  34 
 
 		 164 aa  50.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1208  putative CheW protein  27.89 
 
 		 167 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.10603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  30.48 
 
 		 167 aa  49.7  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  34.74 
 
 		 166 aa  50.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  29.9 
 
 		 155 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  26.81 
 
 		 152 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  26.81 
 
 		 152 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  26.77 
 
 		 174 aa  49.3  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  27.08 
 
 		 766 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  30.43 
 
 		 189 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  32.18 
 
 		 301 aa  48.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  27.46 
 
 		 164 aa  47.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  33.75 
 
 		 170 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  33.75 
 
 		 170 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3259  CheW protein  26.71 
 
 		 158 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105416  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  31.91 
 
 		 174 aa  47.4  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  27.96 
 
 		 169 aa  47.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  29.03 
 
 		 160 aa  47.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  31.63 
 
 		 174 aa  47.4  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  35.29 
 
 		 170 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  34.74 
 
 		 167 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  34.74 
 
 		 167 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  34.74 
 
 		 167 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  34.74 
 
 		 167 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  34.74 
 
 		 167 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  32.35 
 
 		 155 aa  47  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  34.04 
 
 		 174 aa  47  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  25.71 
 
 		 164 aa  47  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  32.65 
 
 		 176 aa  47  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  27.96 
 
 		 171 aa  47  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  35.29 
 
 		 170 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  35.29 
 
 		 165 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  47  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  33.68 
 
 		 167 aa  47  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  35.29 
 
 		 164 aa  47  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  35.79 
 
 		 165 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  29.9 
 
 		 170 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  35.35 
 
 		 165 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  29.9 
 
 		 170 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  29.9 
 
 		 170 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  29.9 
 
 		 170 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  29.9 
 
 		 170 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  29.9 
 
 		 170 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  35.79 
 
 		 165 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  29.9 
 
 		 158 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  31.91 
 
 		 171 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  28.92 
 
 		 164 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  30.93 
 
 		 158 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  27.69 
 
 		 187 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  31.91 
 
 		 177 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  31.91 
 
 		 171 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  31.91 
 
 		 177 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  37.14 
 
 		 161 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  25.21 
 
 		 169 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.34 
 
 		 167 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4818  CheW protein  29.82 
 
 		 157 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596943  hitchhiker  0.00835574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  31.91 
 
 		 171 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5778  CheW protein  29.82 
 
 		 162 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0235487  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  31.91 
 
 		 171 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  32.98 
 
 		 175 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  24.42 
 
 		 319 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3558  CheW protein  26.95 
 
 		 160 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.911694  normal  0.981486 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0728  CheW protein  29.76 
 
 		 185 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000233542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  29.03 
 
 		 163 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  31.91 
 
 		 178 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  25.2 
 
 		 163 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  27.96 
 
 		 163 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  37.33 
 
 		 313 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  31.91 
 
 		 175 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  31.63 
 
 		 176 aa  44.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  31.91 
 
 		 175 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  31.91 
 
 		 175 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  31.91 
 
 		 178 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  29.7 
 
 		 139 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  31.91 
 
 		 175 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  31.91 
 
 		 175 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  25.38 
 
 		 141 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  31.91 
 
 		 175 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  31.91 
 
 		 175 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  31.91 
 
 		 175 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  28.57 
 
 		 163 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>