More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0728 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0728  CheW protein  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000233542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  42.59 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  42.59 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  40.24 
 
 		 187 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  43.68 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  41.38 
 
 		 166 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  42.25 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  38.73 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0568  CheW protein  40.36 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.141879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4377  CheW protein  40.83 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  39.31 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  38.89 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  39.08 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  41.25 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  41.25 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  41.25 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  41.25 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  41.25 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  41.25 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  41.25 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  39.66 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  41.18 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  38.51 
 
 		 163 aa  117  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  37.21 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  37.21 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  38.29 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  37.89 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  38.04 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  37.89 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  36.31 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  36.42 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  38.04 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  44.27 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  37.42 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  44.27 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  44.27 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  37.42 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  44.27 
 
 		 165 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  37.42 
 
 		 175 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  37.36 
 
 		 165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  39.41 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  37.42 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  37.42 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  36.31 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  37.42 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  37.36 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  37.42 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  37.42 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  37.42 
 
 		 171 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  37.42 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  37.42 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  36.63 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0755  CheW protein  37.64 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  37.42 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  36.21 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  37.42 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  37.42 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  37.42 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  45.31 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  36.36 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  37.5 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  36.81 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  38.51 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  41.53 
 
 		 183 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  36.36 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  36.78 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  37.21 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.65 
 
 		 153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  36.78 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  36.2 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  37.04 
 
 		 156 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  43.65 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  43.65 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  43.65 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  36.88 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  36.88 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  36.88 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.55 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  36.88 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  36.88 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  36.88 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  36.88 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  36.88 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  36.2 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  34.09 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  36.65 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  36.65 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  36.65 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  36.65 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  36.65 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  36.48 
 
 		 160 aa  108  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  35.58 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1963  CheW protein  38.51 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.187208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1759  putative CheW protein  38.51 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  36.02 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0149  purine-binding chemotaxis protein CheW  41.86 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  36.25 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  35.58 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3125  CheW protein  38.95 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  34.76 
 
 		 163 aa  105  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>